Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TWF1Q12792 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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