Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRF9Q00978 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IRF9Q00978 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms