Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FGD1P98174 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FGD1P98174 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
FGD1P98174 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FGD1P98174 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
FGD1P98174 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FGD1P98174 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FGD1P98174 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FGD1P98174 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FGD1P98174 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FGD1P98174 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FGD1P98174 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FGD1P98174 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FGD1P98174 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FGD1P98174 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FGD1P98174 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FGD1P98174 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FGD1P98174 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FGD1P98174 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FGD1P98174 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FGD1P98174 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FGD1P98174 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FGD1P98174 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FGD1P98174 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FGD1P98174 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FGD1P98174 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FGD1P98174 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FGD1P98174 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FGD1P98174 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FGD1P98174 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FGD1P98174 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FGD1P98174 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FGD1P98174 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FGD1P98174 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
FGD1P98174 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FGD1P98174 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FGD1P98174 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FGD1P98174 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FGD1P98174 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FGD1P98174 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FGD1P98174 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FGD1P98174 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FGD1P98174 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FGD1P98174 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FGD1P98174 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FGD1P98174 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FGD1P98174 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
FGD1P98174 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FGD1P98174 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FGD1P98174 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FGD1P98174 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FGD1P98174 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FGD1P98174 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FGD1P98174 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
FGD1P98174 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FGD1P98174 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FGD1P98174 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FGD1P98174 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FGD1P98174 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
FGD1P98174 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
FGD1P98174 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FGD1P98174 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FGD1P98174 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FGD1P98174 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FGD1P98174 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FGD1P98174 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FGD1P98174 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FGD1P98174 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FGD1P98174 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FGD1P98174 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FGD1P98174 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FGD1P98174 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
FGD1P98174 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FGD1P98174 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FGD1P98174 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
FGD1P98174 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FGD1P98174 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FGD1P98174 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FGD1P98174 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FGD1P98174 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FGD1P98174 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FGD1P98174 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FGD1P98174 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FGD1P98174 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FGD1P98174 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FGD1P98174 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FGD1P98174 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FGD1P98174 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FGD1P98174 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FGD1P98174 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FGD1P98174 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FGD1P98174 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FGD1P98174 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FGD1P98174 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FGD1P98174 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FGD1P98174 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FGD1P98174 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FGD1P98174 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FGD1P98174 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FGD1P98174 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms