Protein–RNA interactions for Protein: P69905

HBA1, Hemoglobin subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBA1P69905 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HBA1P69905 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HBA1P69905 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HBA1P69905 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HBA1P69905 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HBA1P69905 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HBA1P69905 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HBA1P69905 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HBA1P69905 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HBA1P69905 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HBA1P69905 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HBA1P69905 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HBA1P69905 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HBA1P69905 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HBA1P69905 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HBA1P69905 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HBA1P69905 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HBA1P69905 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HBA1P69905 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HBA1P69905 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HBA1P69905 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HBA1P69905 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HBA1P69905 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HBA1P69905 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HBA1P69905 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HBA1P69905 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HBA1P69905 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HBA1P69905 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HBA1P69905 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HBA1P69905 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HBA1P69905 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HBA1P69905 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HBA1P69905 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HBA1P69905 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HBA1P69905 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HBA1P69905 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HBA1P69905 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HBA1P69905 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HBA1P69905 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HBA1P69905 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HBA1P69905 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HBA1P69905 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HBA1P69905 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HBA1P69905 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HBA1P69905 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HBA1P69905 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HBA1P69905 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HBA1P69905 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HBA1P69905 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HBA1P69905 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HBA1P69905 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HBA1P69905 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HBA1P69905 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HBA1P69905 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HBA1P69905 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HBA1P69905 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HBA1P69905 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HBA1P69905 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HBA1P69905 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HBA1P69905 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HBA1P69905 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HBA1P69905 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HBA1P69905 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HBA1P69905 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HBA1P69905 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HBA1P69905 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HBA1P69905 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HBA1P69905 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HBA1P69905 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HBA1P69905 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HBA1P69905 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HBA1P69905 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HBA1P69905 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HBA1P69905 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HBA1P69905 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HBA1P69905 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HBA1P69905 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HBA1P69905 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HBA1P69905 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HBA1P69905 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HBA1P69905 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HBA1P69905 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HBA1P69905 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HBA1P69905 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HBA1P69905 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HBA1P69905 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HBA1P69905 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HBA1P69905 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HBA1P69905 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HBA1P69905 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HBA1P69905 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HBA1P69905 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HBA1P69905 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HBA1P69905 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HBA1P69905 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HBA1P69905 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HBA1P69905 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HBA1P69905 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HBA1P69905 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HBA1P69905 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms