Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGDP52209 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGDP52209 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGDP52209 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGDP52209 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGDP52209 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGDP52209 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PGDP52209 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGDP52209 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGDP52209 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGDP52209 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGDP52209 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGDP52209 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGDP52209 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGDP52209 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGDP52209 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGDP52209 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGDP52209 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGDP52209 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGDP52209 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PGDP52209 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGDP52209 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGDP52209 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGDP52209 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGDP52209 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGDP52209 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGDP52209 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGDP52209 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PGDP52209 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGDP52209 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGDP52209 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGDP52209 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGDP52209 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGDP52209 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGDP52209 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGDP52209 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGDP52209 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGDP52209 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGDP52209 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PGDP52209 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGDP52209 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGDP52209 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGDP52209 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGDP52209 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGDP52209 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGDP52209 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGDP52209 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGDP52209 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGDP52209 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGDP52209 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGDP52209 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGDP52209 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGDP52209 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGDP52209 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGDP52209 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGDP52209 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGDP52209 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGDP52209 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGDP52209 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGDP52209 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGDP52209 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGDP52209 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGDP52209 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGDP52209 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGDP52209 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGDP52209 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGDP52209 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGDP52209 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PGDP52209 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGDP52209 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGDP52209 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PGDP52209 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGDP52209 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGDP52209 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGDP52209 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGDP52209 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGDP52209 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGDP52209 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGDP52209 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGDP52209 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGDP52209 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGDP52209 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGDP52209 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGDP52209 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGDP52209 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGDP52209 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGDP52209 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGDP52209 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGDP52209 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGDP52209 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PGDP52209 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
PGDP52209 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PGDP52209 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PGDP52209 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PGDP52209 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGDP52209 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGDP52209 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGDP52209 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGDP52209 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGDP52209 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms