Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV1P50549 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV1P50549 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV1P50549 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV1P50549 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV1P50549 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV1P50549 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV1P50549 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV1P50549 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV1P50549 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV1P50549 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV1P50549 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV1P50549 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV1P50549 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV1P50549 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV1P50549 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV1P50549 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV1P50549 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV1P50549 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV1P50549 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV1P50549 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV1P50549 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV1P50549 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV1P50549 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV1P50549 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV1P50549 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV1P50549 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV1P50549 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV1P50549 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV1P50549 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV1P50549 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV1P50549 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV1P50549 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV1P50549 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV1P50549 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV1P50549 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV1P50549 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV1P50549 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV1P50549 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV1P50549 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETV1P50549 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV1P50549 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV1P50549 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV1P50549 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV1P50549 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV1P50549 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV1P50549 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV1P50549 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV1P50549 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV1P50549 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV1P50549 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV1P50549 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV1P50549 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV1P50549 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV1P50549 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV1P50549 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV1P50549 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV1P50549 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV1P50549 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV1P50549 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV1P50549 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV1P50549 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV1P50549 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV1P50549 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV1P50549 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV1P50549 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV1P50549 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV1P50549 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV1P50549 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV1P50549 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV1P50549 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV1P50549 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV1P50549 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV1P50549 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV1P50549 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV1P50549 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV1P50549 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV1P50549 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV1P50549 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV1P50549 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV1P50549 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV1P50549 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV1P50549 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV1P50549 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV1P50549 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ETV1P50549 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV1P50549 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV1P50549 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV1P50549 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV1P50549 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV1P50549 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV1P50549 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV1P50549 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV1P50549 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV1P50549 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV1P50549 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV1P50549 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV1P50549 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV1P50549 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ETV1P50549 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms