Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ERFP50548 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ERFP50548 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERFP50548 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERFP50548 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERFP50548 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERFP50548 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERFP50548 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERFP50548 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERFP50548 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERFP50548 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERFP50548 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERFP50548 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERFP50548 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERFP50548 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERFP50548 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERFP50548 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERFP50548 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERFP50548 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERFP50548 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERFP50548 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERFP50548 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERFP50548 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERFP50548 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERFP50548 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERFP50548 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERFP50548 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERFP50548 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERFP50548 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERFP50548 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERFP50548 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERFP50548 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERFP50548 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERFP50548 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERFP50548 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERFP50548 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERFP50548 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERFP50548 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERFP50548 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERFP50548 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERFP50548 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERFP50548 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERFP50548 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERFP50548 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERFP50548 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERFP50548 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERFP50548 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERFP50548 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERFP50548 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERFP50548 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ERFP50548 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERFP50548 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERFP50548 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERFP50548 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERFP50548 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERFP50548 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERFP50548 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERFP50548 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERFP50548 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERFP50548 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERFP50548 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ERFP50548 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERFP50548 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERFP50548 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERFP50548 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERFP50548 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERFP50548 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERFP50548 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ERFP50548 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERFP50548 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERFP50548 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERFP50548 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERFP50548 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERFP50548 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERFP50548 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERFP50548 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERFP50548 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERFP50548 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERFP50548 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERFP50548 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ERFP50548 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERFP50548 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERFP50548 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERFP50548 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERFP50548 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERFP50548 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERFP50548 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERFP50548 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ERFP50548 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERFP50548 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ERFP50548 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERFP50548 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERFP50548 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERFP50548 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERFP50548 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERFP50548 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERFP50548 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERFP50548 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERFP50548 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERFP50548 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms