Protein–RNA interactions for Protein: P36871

PGM1, Phosphoglucomutase-1, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGM1P36871 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PGM1P36871 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PGM1P36871 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PGM1P36871 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PGM1P36871 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PGM1P36871 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PGM1P36871 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PGM1P36871 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PGM1P36871 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PGM1P36871 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PGM1P36871 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PGM1P36871 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PGM1P36871 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PGM1P36871 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PGM1P36871 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PGM1P36871 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PGM1P36871 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PGM1P36871 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGM1P36871 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGM1P36871 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGM1P36871 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGM1P36871 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGM1P36871 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGM1P36871 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGM1P36871 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGM1P36871 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGM1P36871 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGM1P36871 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGM1P36871 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGM1P36871 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGM1P36871 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGM1P36871 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PGM1P36871 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGM1P36871 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGM1P36871 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGM1P36871 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGM1P36871 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGM1P36871 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PGM1P36871 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGM1P36871 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGM1P36871 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGM1P36871 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGM1P36871 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGM1P36871 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGM1P36871 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGM1P36871 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGM1P36871 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGM1P36871 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGM1P36871 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGM1P36871 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGM1P36871 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PGM1P36871 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGM1P36871 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGM1P36871 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGM1P36871 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGM1P36871 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGM1P36871 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGM1P36871 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGM1P36871 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGM1P36871 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGM1P36871 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGM1P36871 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGM1P36871 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGM1P36871 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGM1P36871 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGM1P36871 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGM1P36871 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGM1P36871 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGM1P36871 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGM1P36871 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGM1P36871 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGM1P36871 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGM1P36871 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGM1P36871 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGM1P36871 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGM1P36871 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGM1P36871 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGM1P36871 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGM1P36871 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGM1P36871 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGM1P36871 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGM1P36871 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PGM1P36871 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGM1P36871 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGM1P36871 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGM1P36871 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGM1P36871 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGM1P36871 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PGM1P36871 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGM1P36871 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGM1P36871 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGM1P36871 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGM1P36871 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGM1P36871 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGM1P36871 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGM1P36871 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGM1P36871 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGM1P36871 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGM1P36871 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGM1P36871 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms