Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms