Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TCP1P17987 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCP1P17987 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCP1P17987 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCP1P17987 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCP1P17987 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCP1P17987 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCP1P17987 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCP1P17987 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCP1P17987 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCP1P17987 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCP1P17987 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCP1P17987 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCP1P17987 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCP1P17987 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCP1P17987 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCP1P17987 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCP1P17987 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCP1P17987 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCP1P17987 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCP1P17987 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCP1P17987 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCP1P17987 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCP1P17987 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCP1P17987 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCP1P17987 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCP1P17987 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCP1P17987 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TCP1P17987 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCP1P17987 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCP1P17987 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCP1P17987 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCP1P17987 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCP1P17987 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCP1P17987 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCP1P17987 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCP1P17987 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TCP1P17987 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCP1P17987 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCP1P17987 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCP1P17987 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCP1P17987 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCP1P17987 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCP1P17987 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCP1P17987 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCP1P17987 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCP1P17987 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCP1P17987 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCP1P17987 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCP1P17987 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCP1P17987 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCP1P17987 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCP1P17987 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCP1P17987 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCP1P17987 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCP1P17987 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCP1P17987 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCP1P17987 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCP1P17987 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCP1P17987 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCP1P17987 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCP1P17987 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCP1P17987 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCP1P17987 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCP1P17987 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCP1P17987 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCP1P17987 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCP1P17987 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCP1P17987 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCP1P17987 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCP1P17987 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCP1P17987 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCP1P17987 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCP1P17987 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCP1P17987 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TCP1P17987 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCP1P17987 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TCP1P17987 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TCP1P17987 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCP1P17987 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCP1P17987 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCP1P17987 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCP1P17987 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCP1P17987 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCP1P17987 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCP1P17987 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TCP1P17987 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCP1P17987 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCP1P17987 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TCP1P17987 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TCP1P17987 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCP1P17987 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCP1P17987 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCP1P17987 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCP1P17987 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCP1P17987 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCP1P17987 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCP1P17987 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCP1P17987 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCP1P17987 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms