Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CREB1P16220 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CREB1P16220 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CREB1P16220 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CREB1P16220 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CREB1P16220 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CREB1P16220 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CREB1P16220 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CREB1P16220 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CREB1P16220 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CREB1P16220 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CREB1P16220 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CREB1P16220 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CREB1P16220 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CREB1P16220 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CREB1P16220 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CREB1P16220 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CREB1P16220 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CREB1P16220 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CREB1P16220 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CREB1P16220 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CREB1P16220 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CREB1P16220 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CREB1P16220 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CREB1P16220 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CREB1P16220 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CREB1P16220 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB1P16220 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB1P16220 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB1P16220 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB1P16220 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB1P16220 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB1P16220 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB1P16220 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB1P16220 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB1P16220 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB1P16220 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB1P16220 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB1P16220 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB1P16220 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB1P16220 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB1P16220 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB1P16220 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB1P16220 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB1P16220 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB1P16220 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB1P16220 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB1P16220 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB1P16220 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB1P16220 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB1P16220 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB1P16220 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB1P16220 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB1P16220 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB1P16220 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB1P16220 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB1P16220 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB1P16220 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB1P16220 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB1P16220 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB1P16220 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB1P16220 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB1P16220 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB1P16220 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB1P16220 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB1P16220 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB1P16220 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CREB1P16220 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CREB1P16220 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CREB1P16220 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CREB1P16220 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CREB1P16220 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CREB1P16220 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CREB1P16220 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CREB1P16220 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CREB1P16220 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CREB1P16220 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CREB1P16220 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CREB1P16220 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CREB1P16220 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CREB1P16220 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CREB1P16220 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CREB1P16220 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CREB1P16220 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CREB1P16220 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CREB1P16220 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CREB1P16220 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CREB1P16220 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CREB1P16220 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CREB1P16220 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CREB1P16220 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CREB1P16220 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CREB1P16220 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CREB1P16220 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
CREB1P16220 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CREB1P16220 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CREB1P16220 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CREB1P16220 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CREB1P16220 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CREB1P16220 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms