Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSP16219 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSP16219 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSP16219 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSP16219 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSP16219 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSP16219 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSP16219 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSP16219 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSP16219 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSP16219 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSP16219 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSP16219 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSP16219 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSP16219 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSP16219 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSP16219 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSP16219 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSP16219 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSP16219 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSP16219 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSP16219 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSP16219 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSP16219 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSP16219 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSP16219 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSP16219 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSP16219 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSP16219 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSP16219 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSP16219 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSP16219 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSP16219 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSP16219 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSP16219 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSP16219 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSP16219 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSP16219 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSP16219 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACADSP16219 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACADSP16219 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACADSP16219 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACADSP16219 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACADSP16219 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACADSP16219 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACADSP16219 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACADSP16219 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACADSP16219 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACADSP16219 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACADSP16219 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACADSP16219 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACADSP16219 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACADSP16219 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACADSP16219 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACADSP16219 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACADSP16219 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACADSP16219 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACADSP16219 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACADSP16219 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACADSP16219 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACADSP16219 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACADSP16219 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACADSP16219 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACADSP16219 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACADSP16219 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACADSP16219 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACADSP16219 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACADSP16219 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACADSP16219 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACADSP16219 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACADSP16219 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACADSP16219 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACADSP16219 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACADSP16219 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACADSP16219 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACADSP16219 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ACADSP16219 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACADSP16219 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACADSP16219 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACADSP16219 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACADSP16219 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACADSP16219 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACADSP16219 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACADSP16219 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACADSP16219 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACADSP16219 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACADSP16219 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACADSP16219 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACADSP16219 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACADSP16219 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACADSP16219 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACADSP16219 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACADSP16219 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACADSP16219 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACADSP16219 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACADSP16219 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACADSP16219 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACADSP16219 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACADSP16219 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACADSP16219 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms