Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC130P13994 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC130P13994 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC130P13994 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC130P13994 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC130P13994 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC130P13994 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC130P13994 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC130P13994 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC130P13994 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC130P13994 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC130P13994 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC130P13994 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC130P13994 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC130P13994 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC130P13994 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC130P13994 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms