Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL6A2P12110 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms