Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOL3O95236 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOL3O95236 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOL3O95236 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOL3O95236 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOL3O95236 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOL3O95236 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOL3O95236 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOL3O95236 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOL3O95236 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOL3O95236 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOL3O95236 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOL3O95236 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOL3O95236 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOL3O95236 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOL3O95236 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOL3O95236 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOL3O95236 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOL3O95236 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOL3O95236 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOL3O95236 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOL3O95236 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOL3O95236 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOL3O95236 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOL3O95236 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOL3O95236 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOL3O95236 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOL3O95236 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOL3O95236 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOL3O95236 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOL3O95236 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOL3O95236 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOL3O95236 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOL3O95236 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOL3O95236 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOL3O95236 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOL3O95236 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOL3O95236 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOL3O95236 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOL3O95236 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOL3O95236 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOL3O95236 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOL3O95236 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOL3O95236 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOL3O95236 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOL3O95236 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOL3O95236 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOL3O95236 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOL3O95236 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOL3O95236 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOL3O95236 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOL3O95236 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOL3O95236 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOL3O95236 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOL3O95236 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOL3O95236 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOL3O95236 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOL3O95236 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
APOL3O95236 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOL3O95236 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOL3O95236 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOL3O95236 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
APOL3O95236 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOL3O95236 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOL3O95236 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
APOL3O95236 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOL3O95236 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOL3O95236 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOL3O95236 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOL3O95236 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOL3O95236 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOL3O95236 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOL3O95236 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOL3O95236 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOL3O95236 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOL3O95236 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOL3O95236 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOL3O95236 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOL3O95236 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOL3O95236 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOL3O95236 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOL3O95236 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOL3O95236 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOL3O95236 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOL3O95236 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOL3O95236 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOL3O95236 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOL3O95236 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
APOL3O95236 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOL3O95236 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOL3O95236 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOL3O95236 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOL3O95236 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOL3O95236 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOL3O95236 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOL3O95236 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOL3O95236 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOL3O95236 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOL3O95236 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOL3O95236 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms