Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms