Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms