Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRAPPC2LQ9UL33 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms