Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms