Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms