Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMG20AQ9NP66 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMG20AQ9NP66 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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