Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZY9

TRIM31, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM31, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM31Q9BZY9 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM31Q9BZY9 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms