Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM55Q9BYV6 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms