Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BRIP1Q9BX63 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms