Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEMA3CQ99985 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms