Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNBD2Q96M20 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms