Protein–RNA interactions for Protein: Q96G79

SLC35A4, Probable UDP-sugar transporter protein SLC35A4, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A4Q96G79 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC35A4Q96G79 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms