Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM12Q96EX1 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms