Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRSK1Q8TDC3 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms