Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AVL9Q8NBF6 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms