Protein–RNA interactions for Protein: Q70UQ0

IKBIP, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBIPQ70UQ0 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IKBIPQ70UQ0 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms