Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms