Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms