Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Q1T7F1 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Q1T7F1 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Q1T7F1 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Q1T7F1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Q1T7F1 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Q1T7F1 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Q1T7F1 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Q1T7F1 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Q1T7F1 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Q1T7F1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Q1T7F1 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Q1T7F1 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Q1T7F1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Q1T7F1 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Q1T7F1 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Q1T7F1 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Q1T7F1 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Q1T7F1 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Q1T7F1 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Q1T7F1 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Q1T7F1 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Q1T7F1 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Q1T7F1 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Q1T7F1 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Q1T7F1 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Q1T7F1 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Q1T7F1 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Q1T7F1 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Q1T7F1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Q1T7F1 IGHG1-202ENST00000390548 2619 ntAPPRIS P5 BASIC9□□□□□ -0.97
Q1T7F1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Q1T7F1 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Q1T7F1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC9□□□□□ -0.97
Q1T7F1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Q1T7F1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Q1T7F1 DENND3-221ENST00000523308 2959 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Q1T7F1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Q1T7F1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Q1T7F1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Q1T7F1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Q1T7F1 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Q1T7F1 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Q1T7F1 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Q1T7F1 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Q1T7F1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Q1T7F1 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Q1T7F1 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Q1T7F1 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Q1T7F1 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Q1T7F1 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Q1T7F1 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Q1T7F1 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Q1T7F1 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Q1T7F1 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Q1T7F1 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Q1T7F1 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Q1T7F1 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC9□□□□□ -0.97
Q1T7F1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Q1T7F1 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Q1T7F1 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Q1T7F1 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Q1T7F1 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Q1T7F1 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Q1T7F1 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Q1T7F1 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Q1T7F1 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Q1T7F1 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Q1T7F1 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Q1T7F1 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Q1T7F1 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Q1T7F1 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Q1T7F1 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Q1T7F1 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Q1T7F1 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Q1T7F1 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Q1T7F1 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Q1T7F1 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Q1T7F1 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Q1T7F1 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Q1T7F1 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Q1T7F1 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Q1T7F1 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Q1T7F1 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Q1T7F1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Q1T7F1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Q1T7F1 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Q1T7F1 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Q1T7F1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Q1T7F1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Q1T7F1 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Q1T7F1 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Q1T7F1 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Q1T7F1 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Q1T7F1 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Q1T7F1 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Q1T7F1 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Q1T7F1 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Q1T7F1 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Q1T7F1 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
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