Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GEN1Q17RS7 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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