Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ATP6V1FQ16864 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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