Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYPL1Q16563 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms