Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
EEA1Q15075 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EEA1Q15075 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
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