Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms