Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.1 ms