Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCLAFQ15004 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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