Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHPRHQ149N8 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
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