Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GTF2H3Q13889 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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