Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CUL4AQ13619 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
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