Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATRQ13535 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATRQ13535 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATRQ13535 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATRQ13535 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATRQ13535 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ATRQ13535 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRQ13535 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRQ13535 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRQ13535 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRQ13535 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRQ13535 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRQ13535 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRQ13535 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRQ13535 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRQ13535 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRQ13535 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRQ13535 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRQ13535 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRQ13535 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRQ13535 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRQ13535 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRQ13535 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRQ13535 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRQ13535 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRQ13535 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRQ13535 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRQ13535 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRQ13535 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRQ13535 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRQ13535 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRQ13535 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRQ13535 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRQ13535 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRQ13535 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRQ13535 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRQ13535 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRQ13535 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRQ13535 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRQ13535 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRQ13535 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRQ13535 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRQ13535 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRQ13535 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRQ13535 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRQ13535 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRQ13535 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRQ13535 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRQ13535 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRQ13535 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRQ13535 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRQ13535 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ATRQ13535 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRQ13535 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRQ13535 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRQ13535 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRQ13535 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRQ13535 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRQ13535 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRQ13535 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRQ13535 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRQ13535 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRQ13535 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRQ13535 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRQ13535 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRQ13535 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRQ13535 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRQ13535 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRQ13535 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRQ13535 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRQ13535 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRQ13535 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRQ13535 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRQ13535 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRQ13535 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRQ13535 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRQ13535 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRQ13535 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRQ13535 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRQ13535 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRQ13535 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRQ13535 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRQ13535 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRQ13535 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRQ13535 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRQ13535 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRQ13535 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRQ13535 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRQ13535 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRQ13535 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRQ13535 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRQ13535 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRQ13535 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ATRQ13535 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
ATRQ13535 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
ATRQ13535 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRQ13535 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRQ13535 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRQ13535 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ATRQ13535 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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