Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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PTPRSQ13332 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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PTPRSQ13332 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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PTPRSQ13332 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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PTPRSQ13332 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRSQ13332 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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PTPRSQ13332 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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PTPRSQ13332 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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PTPRSQ13332 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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PTPRSQ13332 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
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PTPRSQ13332 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
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PTPRSQ13332 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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PTPRSQ13332 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRSQ13332 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRSQ13332 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRSQ13332 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRSQ13332 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRSQ13332 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRSQ13332 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRSQ13332 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRSQ13332 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRSQ13332 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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