Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GTF3C1Q12789 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms