Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SSBP1Q04837 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms