Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK6Q00534 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms