Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP2C1P98194 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP2C1P98194 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP2C1P98194 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP2C1P98194 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP2C1P98194 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP2C1P98194 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP2C1P98194 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP2C1P98194 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP2C1P98194 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP2C1P98194 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP2C1P98194 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP2C1P98194 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP2C1P98194 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP2C1P98194 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP2C1P98194 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP2C1P98194 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP2C1P98194 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP2C1P98194 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP2C1P98194 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP2C1P98194 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP2C1P98194 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP2C1P98194 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP2C1P98194 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP2C1P98194 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP2C1P98194 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP2C1P98194 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP2C1P98194 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP2C1P98194 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP2C1P98194 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP2C1P98194 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP2C1P98194 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP2C1P98194 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP2C1P98194 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP2C1P98194 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP2C1P98194 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP2C1P98194 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP2C1P98194 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP2C1P98194 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP2C1P98194 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP2C1P98194 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP2C1P98194 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP2C1P98194 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP2C1P98194 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP2C1P98194 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP2C1P98194 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP2C1P98194 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP2C1P98194 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP2C1P98194 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP2C1P98194 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP2C1P98194 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP2C1P98194 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP2C1P98194 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP2C1P98194 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP2C1P98194 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP2C1P98194 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP2C1P98194 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP2C1P98194 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP2C1P98194 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms